More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3459 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  296  8e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  90.71 
 
 		 143 aa  271  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  90.71 
 
 		 143 aa  271  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  90.71 
 
 		 143 aa  270  7e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  90 
 
 		 158 aa  269  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  88.73 
 
 		 143 aa  268  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  88.73 
 
 		 143 aa  268  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  88.73 
 
 		 143 aa  268  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  88.73 
 
 		 143 aa  268  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  83.8 
 
 		 143 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  83.57 
 
 		 142 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  83.57 
 
 		 145 aa  244  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  78.17 
 
 		 157 aa  239  9e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05336  transcriptional regulators Psort location  41.96 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  41.5 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 150 aa  86.7  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.25 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 175 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 194 aa  76.6  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5059  transcriptional regulator, AsnC family  32.79 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  31.88 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  31.47 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  31.03 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  28.89 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1435  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.855042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2602  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0876876  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0245  AsnC family transcriptional regulator  74.42 
 
 		 45 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  34.17 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  31.88 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  30.28 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>