More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4079 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  305  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 
143 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  35.04 
 
 
153 aa  97.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
169 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  33.58 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
153 aa  87.4  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
153 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
149 aa  87  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
193 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 
295 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
193 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
154 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  34.31 
 
 
142 aa  84  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
159 aa  84  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2577  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  33.77 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
153 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
143 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  32.14 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  30 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
194 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  32.59 
 
 
145 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  29.22 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  30 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  32.79 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  32.79 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3196  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  31.25 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  28.68 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3240  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2928  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.65 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.66 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>