More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0278 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  280  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  78.01 
 
 		 141 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  76.43 
 
 		 141 aa  231  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  73.57 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  71.43 
 
 		 140 aa  209  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  68.35 
 
 		 175 aa  190  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  58.57 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  58.57 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  58.57 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  54.29 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  54.68 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 140 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 140 aa  140  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  47.48 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 145 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3964  AsnC family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  46.76 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 145 aa  113  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 		 145 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  43.26 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  43.26 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  43.7 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  41.35 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 151 aa  86.7  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  39.85 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  39.26 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 295 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  33.58 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  34.07 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  34.59 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  33.33 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  28.47 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>