More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4567 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  296  6e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  98.6 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  98.6 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  97.9 
 
 		 158 aa  290  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  96.5 
 
 		 143 aa  286  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  96.5 
 
 		 143 aa  286  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  96.5 
 
 		 143 aa  286  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  96.5 
 
 		 143 aa  286  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  90.71 
 
 		 143 aa  270  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  89.51 
 
 		 143 aa  268  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  87.32 
 
 		 142 aa  261  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 145 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  80.71 
 
 		 157 aa  241  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 157 aa  143  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05336  transcriptional regulators Psort location  42.47 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  41.61 
 
 		 151 aa  114  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 142 aa  114  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  34.44 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.51 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  39.81 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5059  transcriptional regulator, AsnC family  32.79 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0245  AsnC family transcriptional regulator  75.56 
 
 		 45 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  30.28 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  32.77 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  34.17 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2602  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0876876  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 159 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  35.34 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  30.28 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  35.17 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  28.15 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.85 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>