More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1244 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  306  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  88.82 
 
 		 152 aa  273  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  89.33 
 
 		 295 aa  273  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  89.33 
 
 		 153 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  89.33 
 
 		 153 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  89.33 
 
 		 193 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  89.33 
 
 		 193 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  88.16 
 
 		 152 aa  270  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  88 
 
 		 154 aa  267  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  86.67 
 
 		 154 aa  263  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  86.67 
 
 		 154 aa  263  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  86.67 
 
 		 154 aa  263  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  86.67 
 
 		 154 aa  263  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  86 
 
 		 154 aa  262  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  86 
 
 		 154 aa  258  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  70.42 
 
 		 153 aa  206  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  66 
 
 		 153 aa  202  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 153 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 153 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  65.77 
 
 		 153 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 153 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  66.2 
 
 		 146 aa  194  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  57.75 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 149 aa  167  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  57.34 
 
 		 152 aa  167  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 164 aa  160  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 159 aa  157  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  57.04 
 
 		 148 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 142 aa  120  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  48.59 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  45.99 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.43 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 143 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  38.85 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  41.01 
 
 		 143 aa  90.5  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  34.56 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4836  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  33.09 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6805  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  34.01 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>