More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1063 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
158 aa  308  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  75.66 
 
 
154 aa  231  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  71.52 
 
 
159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  68.87 
 
 
188 aa  207  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  69.28 
 
 
169 aa  206  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  66.67 
 
 
160 aa  206  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  68.21 
 
 
178 aa  206  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  65.13 
 
 
155 aa  198  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  59.62 
 
 
156 aa  177  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  58.39 
 
 
165 aa  169  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  53.55 
 
 
156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  54.73 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  61.03 
 
 
173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  58.16 
 
 
155 aa  148  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  50.98 
 
 
158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.06 
 
 
155 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.27 
 
 
158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  44.76 
 
 
167 aa  124  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  45.45 
 
 
172 aa  124  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 
167 aa  122  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  45 
 
 
159 aa  117  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 
160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
170 aa  111  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  41.83 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
157 aa  107  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 
157 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
168 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 
157 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  33.33 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
156 aa  94  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
170 aa  92.8  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  39.1 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.67 
 
 
153 aa  92  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 
156 aa  91.7  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.67 
 
 
153 aa  90.9  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  31.17 
 
 
157 aa  90.5  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
153 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  29.22 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
153 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
157 aa  87.8  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.33 
 
 
153 aa  87.4  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.33 
 
 
153 aa  87.4  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.33 
 
 
164 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.33 
 
 
164 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.33 
 
 
164 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  35.71 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  36.62 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.67 
 
 
153 aa  87  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.33 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  31.16 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 
153 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 
153 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 
153 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 
155 aa  85.1  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 
193 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 
193 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
156 aa  84.3  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
156 aa  84  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  33.57 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  38.3 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.45 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.45 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
159 aa  79  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>