More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14170 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 157 aa  306  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  57.24 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  52.35 
 
 		 156 aa  155  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  50.67 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  57.78 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 160 aa  133  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.27 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.45 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  43.54 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  42.45 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.91 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.54 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.77 
 
 		 188 aa  98.6  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  40.15 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  29.53 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  36.5 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  30.13 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  30.46 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1869  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  32 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0682  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  30.2 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  32.45 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0458  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.302522  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>