More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4679 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
178 aa  349  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  90.17 
 
 
188 aa  301  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  68.21 
 
 
158 aa  206  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  66.45 
 
 
160 aa  202  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  66.01 
 
 
154 aa  202  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 
155 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  68.03 
 
 
169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  66.22 
 
 
159 aa  194  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  56 
 
 
156 aa  162  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  55.33 
 
 
165 aa  161  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  58.74 
 
 
173 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  60 
 
 
155 aa  153  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  52.38 
 
 
157 aa  151  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.37 
 
 
155 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 
158 aa  142  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
156 aa  137  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  49.33 
 
 
172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.31 
 
 
158 aa  121  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  45.14 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  42.01 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  37.97 
 
 
170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 
157 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
157 aa  104  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  38.22 
 
 
157 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  42.95 
 
 
152 aa  101  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 
160 aa  100  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
168 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  37.25 
 
 
155 aa  97.4  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.57 
 
 
159 aa  96.3  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 
156 aa  84  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.76 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.67 
 
 
153 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.43 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  26.97 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.76 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.76 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.05 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.76 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.08 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  27.52 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.29 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  36.11 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.43 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.33 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.41 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.41 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.41 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.76 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
155 aa  77  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 
151 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  28.57 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  32.23 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  32.23 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  27.52 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.7 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.89 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.61 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  30.87 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  30.61 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.05 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.73 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.73 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.21 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0920  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.681617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>