More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31820 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
155 aa  297  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  84.4 
 
 
173 aa  235  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  62.16 
 
 
169 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  60.14 
 
 
154 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  60.67 
 
 
159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  58.67 
 
 
178 aa  163  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  57.33 
 
 
188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  58.67 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  56.77 
 
 
158 aa  159  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  54.84 
 
 
160 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  53.9 
 
 
156 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  52.05 
 
 
157 aa  149  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  52.38 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.67 
 
 
155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  55.03 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.32 
 
 
158 aa  138  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  47.44 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 
167 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.36 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 
160 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  45.95 
 
 
172 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 
168 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 
157 aa  113  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
169 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 
156 aa  107  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
170 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  39.6 
 
 
157 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
157 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
157 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  40.58 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
155 aa  87.8  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.43 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.19 
 
 
153 aa  83.6  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  39.01 
 
 
153 aa  82  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
153 aa  82  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  33.33 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.51 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.08 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.01 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  36.11 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.73 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
152 aa  77  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.73 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.86 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.73 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.73 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.73 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.41 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.86 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.73 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.73 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.45 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.53 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.45 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  29.73 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.86 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>