More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1380 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  313  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  92.21 
 
 		 157 aa  285  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  51.32 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  48.72 
 
 		 157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  57.46 
 
 		 157 aa  160  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  52.94 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  51.33 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  46.36 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  42.68 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 155 aa  123  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.84 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.42 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 178 aa  104  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 170 aa  100  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 		 165 aa  97.4  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 168 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  31.29 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  31.82 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0849  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  31.88 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  30.46 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  29.92 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  31.51 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1853  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.199579  normal  0.332251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  32.19 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  29.37 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  30.52 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.86 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  31.11 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  31.37 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0997  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.488133  normal  0.0113104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>