More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0706 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 173 aa  335  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  84.4 
 
 		 155 aa  235  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  62.42 
 
 		 169 aa  178  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  58.9 
 
 		 188 aa  174  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  62.75 
 
 		 159 aa  168  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 178 aa  165  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  59.73 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  55.84 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  55.63 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  52.03 
 
 		 157 aa  147  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 158 aa  140  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.65 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  52.83 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.34 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 156 aa  127  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  47.33 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  45.27 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.76 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 160 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  38.85 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 		 157 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  41.89 
 
 		 152 aa  98.6  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  39.71 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 153 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 153 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  31.76 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 		 153 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.45 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  33.33 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 		 153 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  30.26 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  33.33 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  35.97 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  38.52 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.08 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.08 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.08 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.08 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.4 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.4 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.89 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 153 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  28.66 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.89 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>