More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5648 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  276  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  72.86 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  71.94 
 
 		 143 aa  205  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  71.22 
 
 		 143 aa  204  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  71.22 
 
 		 143 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  70.5 
 
 		 143 aa  202  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  70.71 
 
 		 140 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  70.71 
 
 		 140 aa  201  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  70.5 
 
 		 143 aa  201  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  70 
 
 		 140 aa  199  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  70.71 
 
 		 140 aa  196  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  68.57 
 
 		 143 aa  186  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 140 aa  169  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  68.57 
 
 		 143 aa  169  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 175 aa  151  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 141 aa  150  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  53.57 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  55 
 
 		 141 aa  140  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 153 aa  139  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  53.24 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  53.24 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  50.36 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  48.91 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 141 aa  120  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3964  AsnC family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  47.48 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  46.76 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  43.8 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 143 aa  105  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  41.91 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 164 aa  98.6  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 153 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 154 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 153 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  39.42 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 147 aa  93.6  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 153 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  37.96 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  40.3 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 169 aa  90.1  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 193 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 193 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  39.71 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 149 aa  87  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 295 aa  87  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 146 aa  87.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  31.88 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.85 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  34.07 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 		 155 aa  76.6  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>