More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3855 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
157 aa  306  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  78.34 
 
 
157 aa  244  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  58.55 
 
 
157 aa  180  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 
157 aa  176  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  52.63 
 
 
156 aa  159  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  54.61 
 
 
155 aa  149  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  56.38 
 
 
157 aa  147  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 
160 aa  134  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.41 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 
157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
167 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.17 
 
 
159 aa  110  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.27 
 
 
155 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 
169 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
169 aa  102  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 
170 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 
168 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 
161 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  40.71 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 
157 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 
158 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 
160 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 
173 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.16 
 
 
188 aa  90.5  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  39.46 
 
 
165 aa  88.6  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
168 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 
156 aa  87  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
178 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  30.34 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  38.17 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  30.71 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0682  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  31.82 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  29.25 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  32.84 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  35.34 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  34.88 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 
153 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  36.79 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  31.01 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  31.16 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  34.09 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  32.06 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
168 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  29.22 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  26.85 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>