More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4365 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
153 aa  304  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  60.84 
 
 
143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  55.88 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  53.68 
 
 
141 aa  141  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  53.68 
 
 
141 aa  140  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  50.36 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  48.55 
 
 
143 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  48.53 
 
 
145 aa  134  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  50 
 
 
148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  47.83 
 
 
143 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  47.83 
 
 
143 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 
143 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 
143 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  44.12 
 
 
138 aa  130  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
145 aa  130  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  46.32 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 
140 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  44.12 
 
 
144 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  41.91 
 
 
140 aa  123  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  42.45 
 
 
175 aa  122  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
141 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
141 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
143 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  41.91 
 
 
145 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  45.59 
 
 
143 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
143 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  45.59 
 
 
145 aa  120  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  45.59 
 
 
145 aa  120  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  44.12 
 
 
141 aa  120  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  45.59 
 
 
140 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  45.59 
 
 
140 aa  120  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  44.12 
 
 
145 aa  120  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  40.44 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  44.85 
 
 
140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  44.85 
 
 
140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3964  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
145 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  41.73 
 
 
141 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  36.43 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
143 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  34.07 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
154 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 
147 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
153 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
153 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
193 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
193 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
295 aa  84.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
154 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 
143 aa  84  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 
143 aa  84  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  33.82 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  34.85 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  34.07 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.12 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  29.1 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  30.37 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  28.36 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  27.86 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30.83 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.89 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>