More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2854 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  337  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  83.54 
 
 		 161 aa  276  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 155 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.14 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  38.61 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 158 aa  111  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.74 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  41.94 
 
 		 155 aa  107  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 		 157 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  34.84 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 169 aa  100  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 155 aa  98.6  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 		 159 aa  97.4  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  39.26 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  29.14 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  31.21 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  27.01 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.78 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  32.5 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.56 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.71 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0383  AsnC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.900371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.46 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.71 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.71 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.71 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.28 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  29.91 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  28.48 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  25.55 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 148 aa  62  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.28 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.85 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>