More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1908 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
168 aa  342  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  57.96 
 
 
160 aa  210  7.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  57.86 
 
 
159 aa  209  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
155 aa  125  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 
158 aa  117  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  40.43 
 
 
157 aa  115  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  38.85 
 
 
156 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 
155 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  38.19 
 
 
150 aa  103  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.55 
 
 
154 aa  101  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  36.55 
 
 
154 aa  101  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.17 
 
 
153 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.93 
 
 
153 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.93 
 
 
153 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.93 
 
 
153 aa  99.8  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.01 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
153 aa  95.5  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 
156 aa  95.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 
149 aa  94.4  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
155 aa  94  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
153 aa  94  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.88 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.76 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.9 
 
 
152 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.9 
 
 
152 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.9 
 
 
152 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.86 
 
 
153 aa  92.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.1 
 
 
153 aa  92  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.23 
 
 
152 aa  91.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
153 aa  91.7  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.23 
 
 
152 aa  91.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
153 aa  91.3  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
164 aa  90.9  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
164 aa  90.9  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
164 aa  90.9  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
164 aa  90.9  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 
153 aa  90.5  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.47 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.25 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
152 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
150 aa  87.8  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.89 
 
 
152 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 
152 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.89 
 
 
152 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  32.89 
 
 
152 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.89 
 
 
152 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.89 
 
 
152 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.89 
 
 
152 aa  87.4  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.89 
 
 
152 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  29.87 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  31.09 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  24.67 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.47 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  27.46 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  27.21 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  34.45 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  24.55 
 
 
169 aa  72  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.09 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  25.97 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  35.83 
 
 
157 aa  70.5  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  26.62 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  30.41 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4759  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  25.53 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.49 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  26.53 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3829  AsnC family transcriptional regulator  25.85 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  27.46 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>