More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0688 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
155 aa  305  2.0000000000000002e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  71.33 
 
 
153 aa  219  8e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  50.71 
 
 
156 aa  147  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 
149 aa  102  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.11 
 
 
153 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.72 
 
 
153 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.72 
 
 
153 aa  95.5  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.72 
 
 
153 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.42 
 
 
153 aa  94.4  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.72 
 
 
153 aa  94  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
143 aa  94  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.03 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  39.01 
 
 
167 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.21 
 
 
154 aa  90.9  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 
174 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 
153 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
151 aa  90.1  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 
174 aa  90.1  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
153 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 
158 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 
163 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.06 
 
 
150 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
167 aa  87.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.06 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
175 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0883  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
164 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0448887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0920  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.681617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0739  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0726  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
182 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0994  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.14 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.14 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  33.58 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  33.58 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.14 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.14 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.14 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  35.14 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.14 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.14 
 
 
152 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 
169 aa  85.5  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
154 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  32.58 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
158 aa  84.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.64 
 
 
153 aa  84.3  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.78 
 
 
152 aa  84  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  84  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.78 
 
 
152 aa  84  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.78 
 
 
152 aa  84  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  34.11 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.64 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.78 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.78 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0383  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.900371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.85 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  32.87 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  35.07 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  30.87 
 
 
174 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.94 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.64 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.25 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.64 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.64 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.64 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>