More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3982 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  100 
 
 
153 aa  316  7e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  94.08 
 
 
154 aa  302  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  92.81 
 
 
153 aa  298  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  92.16 
 
 
153 aa  298  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  88.89 
 
 
153 aa  285  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  84.97 
 
 
153 aa  271  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  84.31 
 
 
153 aa  269  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  84.31 
 
 
153 aa  269  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  84.31 
 
 
153 aa  269  9e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  86.58 
 
 
152 aa  267  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  85.23 
 
 
152 aa  266  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  85.23 
 
 
152 aa  266  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  85.23 
 
 
152 aa  266  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  85.91 
 
 
152 aa  265  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  85.91 
 
 
152 aa  265  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  85.91 
 
 
152 aa  265  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  85.91 
 
 
152 aa  265  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  85.91 
 
 
152 aa  265  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  85.91 
 
 
152 aa  265  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  85.91 
 
 
152 aa  265  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  85.91 
 
 
152 aa  265  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  84.56 
 
 
152 aa  264  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  84.56 
 
 
152 aa  264  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.86 
 
 
153 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.86 
 
 
153 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.51 
 
 
153 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.86 
 
 
164 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.86 
 
 
164 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.86 
 
 
164 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.86 
 
 
164 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.51 
 
 
164 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.51 
 
 
164 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.51 
 
 
164 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.86 
 
 
153 aa  241  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.5 
 
 
153 aa  241  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.86 
 
 
153 aa  241  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.2 
 
 
153 aa  240  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.5 
 
 
153 aa  240  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.5 
 
 
153 aa  238  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  72.11 
 
 
153 aa  229  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  69.08 
 
 
154 aa  223  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  68.42 
 
 
154 aa  221  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  67.97 
 
 
153 aa  219  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  68.24 
 
 
150 aa  214  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  50.68 
 
 
156 aa  150  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  50.68 
 
 
156 aa  149  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  50.34 
 
 
157 aa  147  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  47.59 
 
 
155 aa  141  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  44.83 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 
155 aa  130  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  42.76 
 
 
156 aa  130  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
155 aa  120  7e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  36.36 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 
168 aa  95.5  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
155 aa  94.4  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 
153 aa  90.5  8e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
156 aa  87.8  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.25 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
158 aa  83.6  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
164 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  33.85 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  30.94 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  27.54 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.7 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 
167 aa  77  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 
167 aa  77  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  30.77 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  33.05 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3829  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3288  precursor of collagen, alpha 2(V)  34.04 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0142731 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0849  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0997  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.488133  normal  0.0113104 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4759  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  28.38 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>