More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3288 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3288  precursor of collagen, alpha 2(V)  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0142731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0739  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0726  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0994  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0920  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.681617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0883  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0448887  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  37.09 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.52 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3068  transcriptional regulator, AsnC family  43.17 
 
 		 165 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 		 159 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5387  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138805  normal  0.471727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  38.56 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2310  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 171 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 165 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 		 156 aa  90.5  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 152 aa  90.5  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 153 aa  90.1  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 157 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  33.96 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 180 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 164 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 158 aa  88.2  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 164 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 		 160 aa  87  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0580  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 178 aa  87  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015391  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.73 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  34.84 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1969  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.76 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 213 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  32.73 
 
 		 171 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 171 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  32.73 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  32.73 
 
 		 171 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 171 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  32.73 
 
 		 171 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  32.73 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  33.55 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03485  regulatory protein, AsnC/Lrp  32.45 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 222 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 169 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  84.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  32.73 
 
 		 222 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 157 aa  84.3  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 163 aa  84  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 159 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  84  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  35.71 
 
 		 175 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  35.71 
 
 		 175 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  35.71 
 
 		 175 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  35.71 
 
 		 175 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  35.71 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  35.06 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>