More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0590 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
158 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
158 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
158 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
158 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
158 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
158 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
192 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 
160 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
155 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  42.52 
 
 
126 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
192 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  34.93 
 
 
173 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  34.93 
 
 
173 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
160 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
160 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 
155 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 
154 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 
165 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 
160 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  31.13 
 
 
161 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
155 aa  102  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
156 aa  102  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  33.79 
 
 
153 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  33.79 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  33.79 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  33.79 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 
158 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 
158 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  29.8 
 
 
158 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
165 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
154 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 
154 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 
154 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0850  glutamate uptake regulatory protein Grp  39.68 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  31.97 
 
 
155 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 
165 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2701  AsnC family transcriptional regulator  35.2 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0065289  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 
165 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 
154 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 
163 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.86 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4109  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
155 aa  89.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  31.13 
 
 
153 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
165 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  29.41 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05577  transcription regulator protein  34.93 
 
 
186 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47707  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 
157 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 
166 aa  87  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
168 aa  87  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
161 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 
153 aa  87  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 
153 aa  87  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 
165 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
167 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  31.54 
 
 
162 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  31.93 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  31.54 
 
 
162 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.26 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  32.87 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2003  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647714  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  24.83 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  32.48 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  39.52 
 
 
188 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4492  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
178 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>