More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4298 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 158 aa  322  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 158 aa  322  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  58.55 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 161 aa  168  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  54 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  55.13 
 
 		 160 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 192 aa  152  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 158 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0948  AsnC family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 180 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  52 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  43.67 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  47.68 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  47.68 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  47.68 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  47.02 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  41.45 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  38.56 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  35.76 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  35.76 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  41.94 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  36.54 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  36.84 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 150 aa  101  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 		 153 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  32.68 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  37.11 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 188 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2804  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 169 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 149 aa  84.3  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>