More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2708 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  310  4.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 155 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 159 aa  160  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 165 aa  157  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  45.1 
 
 		 161 aa  153  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  46.67 
 
 		 158 aa  151  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 192 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 180 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  37.93 
 
 		 173 aa  125  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  38.46 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  45.97 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  34.42 
 
 		 161 aa  114  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 192 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  35.66 
 
 		 153 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  35.66 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  35.66 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  35.66 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  32.68 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 168 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  34 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 160 aa  99.4  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  35.33 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  32 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 		 161 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 		 161 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 177 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 166 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 157 aa  97.1  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 		 154 aa  97.1  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  34 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 188 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 172 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  34.44 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 163 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 163 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>