More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1559 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
164 aa  332  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
164 aa  332  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  99.39 
 
 
164 aa  331  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  98.17 
 
 
164 aa  328  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  98.17 
 
 
164 aa  328  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  98.17 
 
 
164 aa  328  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  98.17 
 
 
164 aa  328  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  80.38 
 
 
163 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  80.38 
 
 
163 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  79.38 
 
 
185 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  80.38 
 
 
163 aa  256  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  80.25 
 
 
163 aa  255  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  78.62 
 
 
163 aa  253  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  58 
 
 
165 aa  174  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  56.08 
 
 
160 aa  166  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0619  transcriptional regulator, AsnC family  56.77 
 
 
163 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0640  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 
163 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449477  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  51.2 
 
 
171 aa  158  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  50.96 
 
 
163 aa  158  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  57.34 
 
 
168 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
161 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1081  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 
161 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0559  AsnC family transcriptional regulator  50.96 
 
 
162 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  40.62 
 
 
159 aa  118  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  39.07 
 
 
158 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
170 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
165 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
160 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  35.62 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  35.62 
 
 
173 aa  107  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  39.47 
 
 
159 aa  107  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 
161 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 
161 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
156 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  38.31 
 
 
160 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2964  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
172 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116625  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
153 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
160 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  37.09 
 
 
152 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
156 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 
176 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
156 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 
154 aa  101  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 
168 aa  100  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  36.42 
 
 
152 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
161 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 
164 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
171 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
158 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 
156 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
158 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
158 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
157 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
158 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  36.84 
 
 
169 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 
154 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
158 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  37.58 
 
 
155 aa  99  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
181 aa  99  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  33.55 
 
 
162 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  35.33 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
157 aa  98.6  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
161 aa  98.2  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 
166 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 
165 aa  97.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
157 aa  97.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
159 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
154 aa  97.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
157 aa  97.4  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  34.64 
 
 
161 aa  97.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
159 aa  97.1  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 
155 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 
155 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0399  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 
175 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
177 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 
155 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 
159 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 
155 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>