More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1081 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1081  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  324  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  69.81 
 
 		 160 aa  223  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  69.18 
 
 		 165 aa  221  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  67.3 
 
 		 161 aa  203  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  61.01 
 
 		 163 aa  197  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 171 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0640  AsnC family transcriptional regulator  62.35 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0619  transcriptional regulator, AsnC family  62.66 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0559  AsnC family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 163 aa  150  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  37.01 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  38.12 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  36.31 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  98.6  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 180 aa  98.2  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  38.31 
 
 		 158 aa  97.4  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 158 aa  97.1  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  39.62 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 156 aa  94.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 170 aa  94  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  35.03 
 
 		 156 aa  94  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  34.87 
 
 		 155 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 168 aa  90.5  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 160 aa  90.5  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 156 aa  90.5  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  34.39 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  32.9 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  37.11 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  34.21 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 200 aa  87.8  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 200 aa  87.8  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 176 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  31.17 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 175 aa  85.1  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  31.85 
 
 		 154 aa  84.7  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 152 aa  84.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 168 aa  84.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 168 aa  84.3  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 168 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 168 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 168 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 158 aa  84.3  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 162 aa  84.3  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 155 aa  84  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 164 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 		 159 aa  84  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 165 aa  84  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 147 aa  84  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 157 aa  84  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  32.47 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  32.9 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>