More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1900 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  315  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  35.53 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  34.87 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 156 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 185 aa  103  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  35.81 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.49 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  41.78 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 163 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  34.44 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  34.44 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.76 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  34.44 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  34.44 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  36.97 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  36.97 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  36.97 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  36.97 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  36.97 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  38.71 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2001  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 222 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1694  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.849273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 171 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 218 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  36.97 
 
 		 222 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 		 162 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 		 162 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 188 aa  97.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 171 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 174 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 163 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1180  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0727  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1207  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371155  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4315  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169505  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  33.11 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  33.11 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  33.11 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  33.11 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  33.11 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.892509 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.79 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 174 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 198 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 169 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  31.79 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3081  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  35.9 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3223  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  35.85 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 174 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3042  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1090  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540988  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 174 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>