More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4037 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
163 aa  328  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0619  transcriptional regulator, AsnC family  78.75 
 
 
163 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  71.7 
 
 
165 aa  241  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0640  AsnC family transcriptional regulator  79.35 
 
 
163 aa  242  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449477  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  69.81 
 
 
160 aa  237  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  69.62 
 
 
171 aa  225  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  67.3 
 
 
161 aa  216  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1081  AsnC family transcriptional regulator  61.01 
 
 
161 aa  197  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0559  AsnC family transcriptional regulator  60.38 
 
 
162 aa  183  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  59.49 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  51.3 
 
 
163 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  50.65 
 
 
163 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  50.96 
 
 
164 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  51.3 
 
 
163 aa  158  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  50.96 
 
 
164 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  50.65 
 
 
163 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  50.32 
 
 
164 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  50.97 
 
 
185 aa  157  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 
164 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 
164 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 
164 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 
164 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
163 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  33.12 
 
 
173 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  33.12 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  40.62 
 
 
158 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  34.42 
 
 
162 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
150 aa  105  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
155 aa  105  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  37.11 
 
 
192 aa  104  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
156 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  35.26 
 
 
160 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 
156 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4492  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
178 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  34.42 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 
164 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
159 aa  95.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 
164 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  94  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3149  transcriptional regulator, AsnC family  36.71 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3876  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 
191 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  34.16 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  34.16 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  28.21 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
165 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 
155 aa  90.9  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  33.12 
 
 
157 aa  90.9  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
153 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  32.69 
 
 
155 aa  90.5  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  32.48 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
157 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.77 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  31.01 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  36.77 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  33.77 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  33.54 
 
 
158 aa  88.6  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 
158 aa  88.6  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  35.03 
 
 
165 aa  88.2  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  34.62 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
162 aa  88.2  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  30.19 
 
 
192 aa  87.8  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
159 aa  87.8  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
156 aa  87.4  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  32.7 
 
 
156 aa  87.4  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  38.71 
 
 
159 aa  87.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
162 aa  87  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
180 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2003  transcriptional regulator, AsnC family  36.77 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647714  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  36.77 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  33.73 
 
 
165 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  31.41 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  31.1 
 
 
164 aa  87  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  38.71 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  33.77 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 
155 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  33.77 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.892509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3619  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.378157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  33.77 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  33.77 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>