More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0559 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0559  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  324  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 163 aa  183  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  58.13 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0640  AsnC family transcriptional regulator  63.23 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0619  transcriptional regulator, AsnC family  63.23 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  58.49 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 171 aa  175  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1081  AsnC family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  59.48 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 163 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 185 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 180 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 192 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  37.82 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 158 aa  94.4  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 158 aa  94.4  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  33.76 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  34.59 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2821  regulatory protein AsnC/Lrp family  33.75 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 192 aa  91.3  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  34.38 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3876  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 191 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3149  transcriptional regulator, AsnC family  37.01 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 155 aa  88.6  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 150 aa  88.2  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4492  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 178 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  30.52 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  33.97 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  33.97 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  33.97 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  33.97 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 202 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 175 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  30.52 
 
 		 173 aa  85.1  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  33.97 
 
 		 229 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  31.17 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  84.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 202 aa  84.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2822  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 158 aa  84.3  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.448359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 162 aa  84  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 154 aa  84  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  34.84 
 
 		 161 aa  84  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  34.84 
 
 		 161 aa  84  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  31.29 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  35.71 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  35.06 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  29.87 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2003  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  37.42 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  29.94 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  32.9 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  30.52 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>