More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5075 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  79.38 
 
 		 160 aa  270  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  81.25 
 
 		 160 aa  270  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  67.97 
 
 		 162 aa  221  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 192 aa  186  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 158 aa  177  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  57.62 
 
 		 158 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 158 aa  173  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  56.29 
 
 		 158 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  56.29 
 
 		 158 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 192 aa  163  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  46.5 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  51.32 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  46.71 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  46.71 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  46.71 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  46.05 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 155 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  41.45 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  37.09 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  35.17 
 
 		 173 aa  117  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  44.8 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  34.87 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0948  AsnC family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  34.48 
 
 		 173 aa  114  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 165 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 165 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 150 aa  110  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 185 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  33.55 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  31.58 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 164 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 166 aa  97.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 164 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.8 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  30.46 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 169 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  29.8 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  34.19 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  33.55 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  35.71 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  31.13 
 
 		 162 aa  95.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 162 aa  94.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>