More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1344 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  310  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  69.59 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0093  AsnC family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.867547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 192 aa  133  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  40.85 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  43.66 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  39.86 
 
 		 173 aa  124  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  39.86 
 
 		 173 aa  123  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 180 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  40.56 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  40.56 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  40.56 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  40.43 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  43.26 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  36.81 
 
 		 166 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  34.67 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  36.6 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  36.6 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  36.36 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  34.67 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  34.93 
 
 		 168 aa  97.4  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  34.93 
 
 		 168 aa  97.4  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  43.88 
 
 		 160 aa  97.4  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  34.93 
 
 		 168 aa  97.4  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  34.93 
 
 		 168 aa  97.4  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  34.93 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  34.93 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  34.93 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  34.93 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  34.93 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  34.67 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  34.67 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 156 aa  94.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.1 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  46.02 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  33.1 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  34.25 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  37.32 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  35.66 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 176 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  32.88 
 
 		 164 aa  90.5  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  32.41 
 
 		 152 aa  90.5  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  32.41 
 
 		 152 aa  90.5  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.892509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 168 aa  90.5  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  32.41 
 
 		 152 aa  90.5  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  32.41 
 
 		 152 aa  90.5  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  32.41 
 
 		 152 aa  90.5  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  33.33 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>