More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0948 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0948  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 121 aa  249  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  62.07 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  62.07 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  52.94 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  50.41 
 
 		 160 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  47.93 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 192 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  42.86 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  42.98 
 
 		 161 aa  103  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  45.13 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  45.13 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  45.13 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  44.25 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 165 aa  96.7  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  43.7 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  35.83 
 
 		 173 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  35 
 
 		 173 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 160 aa  76.6  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  37.07 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  35.04 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  32.77 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  34.45 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  34.15 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  33.61 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 163 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 163 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  33 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0619  transcriptional regulator, AsnC family  33.94 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0640  AsnC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  34.26 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  36.7 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  34.21 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4811  transcriptional regulator, AsnC family  28.3 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  31.13 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4392  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02115  leucine-responsive transcriptional regulator  31.78 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000100067  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  27.62 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  31.78 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  31.36 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>