More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3532 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  321  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  69.59 
 
 		 160 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0093  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.867547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  45.32 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 165 aa  120  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  38.85 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  38.85 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 192 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 150 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 150 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  34.27 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  35.92 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  35.92 
 
 		 153 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  35.92 
 
 		 153 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  35.92 
 
 		 153 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 150 aa  97.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 155 aa  97.1  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 158 aa  97.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  35.77 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 156 aa  87.4  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 160 aa  87.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 157 aa  87  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  37.01 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  41.59 
 
 		 126 aa  84  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 188 aa  84  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  31.47 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  33.11 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  29.93 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  29.03 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  29.86 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  29.93 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  29.93 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  29.93 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  29.93 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  34.87 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  27.74 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  29.93 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  29.93 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  29.93 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  30.07 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  29.93 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  30.77 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  34.87 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  34.87 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  28.76 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  33.57 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.24 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  32.69 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  29.37 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>