More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2839 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  51.66 
 
 		 162 aa  167  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  56.67 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  50.31 
 
 		 158 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  50.31 
 
 		 158 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 		 160 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  40.37 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  41.03 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 158 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  40.38 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  44.83 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  44.83 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  44.83 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  44.14 
 
 		 153 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  42.76 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 159 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 160 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 160 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 180 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 154 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 155 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  46.77 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 150 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 150 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  37.5 
 
 		 158 aa  118  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 154 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 155 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  38.16 
 
 		 158 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 155 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 168 aa  111  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 160 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  36.71 
 
 		 161 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 150 aa  107  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0948  AsnC family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 121 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 163 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 164 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 165 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 160 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  36.77 
 
 		 155 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 169 aa  94.7  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 169 aa  94.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 160 aa  94.4  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2804  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 169 aa  94  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  39.38 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  41.03 
 
 		 161 aa  93.6  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  39.38 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 		 158 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 161 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  36.18 
 
 		 155 aa  92.8  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 		 161 aa  92.8  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 		 161 aa  92.8  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 157 aa  92.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 153 aa  92  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 153 aa  92  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 157 aa  92.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2003  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2310  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 153 aa  92  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 173 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  36.13 
 
 		 155 aa  91.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  36.18 
 
 		 169 aa  91.7  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  39.38 
 
 		 162 aa  91.7  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  38.12 
 
 		 161 aa  91.3  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2868  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 153 aa  91.3  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 156 aa  91.3  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 171 aa  91.3  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 181 aa  90.9  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0559  AsnC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 162 aa  91.3  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  40.38 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 153 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0458  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.302522  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  34.87 
 
 		 152 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 154 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>