More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0674 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
165 aa  333  7.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  80.62 
 
 
160 aa  269  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  71.7 
 
 
163 aa  241  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0640  AsnC family transcriptional regulator  77.62 
 
 
163 aa  228  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449477  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0619  transcriptional regulator, AsnC family  77.62 
 
 
163 aa  228  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  72.33 
 
 
161 aa  227  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1081  AsnC family transcriptional regulator  69.18 
 
 
161 aa  221  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  63.29 
 
 
171 aa  203  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  67.79 
 
 
168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  56.88 
 
 
163 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  58.67 
 
 
164 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  56.88 
 
 
163 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  56.25 
 
 
163 aa  175  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  58 
 
 
164 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  58 
 
 
164 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  57.79 
 
 
163 aa  173  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  57.79 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  56.25 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0559  AsnC family transcriptional regulator  58.82 
 
 
162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  57.33 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  57.33 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  57.33 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  57.33 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  39.61 
 
 
173 aa  117  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  39.61 
 
 
173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  40.13 
 
 
158 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
156 aa  104  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
160 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
160 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
165 aa  100  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
154 aa  100  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
156 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  40.26 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 
156 aa  99  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 
162 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4492  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 
178 aa  98.6  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
157 aa  97.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
155 aa  97.8  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
155 aa  97.8  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
192 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
180 aa  95.5  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 
159 aa  94.7  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 
155 aa  94.4  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 
156 aa  94  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
165 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  43.15 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
176 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3619  transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 
174 aa  91.7  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.378157  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
160 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3876  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
191 aa  90.9  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3149  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 
169 aa  90.5  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 
200 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 
169 aa  90.9  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 
200 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  33.76 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  33.76 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  36.02 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  33.76 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  30.5 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  38.36 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
169 aa  89.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  38.13 
 
 
160 aa  89  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 
180 aa  89  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 
164 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  40.85 
 
 
169 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  32.69 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  41.46 
 
 
155 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3674  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 
172 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  32.69 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
192 aa  88.2  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
171 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  40.85 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  32.69 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 
165 aa  88.2  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1802  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.16 
 
 
168 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596593  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.25 
 
 
163 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  34.01 
 
 
160 aa  88.2  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 
166 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 
158 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 
158 aa  87.8  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 
162 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>