More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0640 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0640  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0619  transcriptional regulator, AsnC family  99.39 
 
 		 163 aa  324  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  79.35 
 
 		 163 aa  258  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  75.95 
 
 		 165 aa  243  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 160 aa  236  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  72.26 
 
 		 161 aa  228  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  72.08 
 
 		 171 aa  221  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1081  AsnC family transcriptional regulator  62.35 
 
 		 161 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0559  AsnC family transcriptional regulator  63.23 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  61.88 
 
 		 168 aa  184  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 164 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 164 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  56.13 
 
 		 164 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 163 aa  167  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 185 aa  166  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 163 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 163 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 163 aa  163  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  43.87 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  37.01 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4492  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3149  transcriptional regulator, AsnC family  38.61 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3876  AsnC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 192 aa  97.4  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0428  putative leucine-responsive regulatory protein  37.01 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749844  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1797  putative leucine-responsive regulatory protein  37.01 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1387  putative leucine-responsive regulatory protein  37.01 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0951  putative leucine-responsive regulatory protein  37.01 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0345  Lrp regulator  37.01 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0217  putative leucine-responsive regulatory protein  37.01 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1881  putative leucine-responsive regulatory protein  37.01 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112233  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 160 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 160 aa  94.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2003  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 173 aa  94  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05577  transcription regulator protein  37.58 
 
 		 186 aa  94  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47707  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 173 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1100  leucine-responsive regulatory protein, putative  35.9 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5406  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  36.69 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  36.54 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  36.69 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  36.69 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  36.69 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  36.69 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  36.69 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  36.69 
 
 		 222 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 222 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3619  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.378157  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 200 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 158 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 200 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 180 aa  91.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 161 aa  91.3  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1802  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.01 
 
 		 168 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596593  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  35.71 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 155 aa  91.3  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 160 aa  90.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>