More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5900 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  69.62 
 
 		 163 aa  225  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  69.28 
 
 		 161 aa  213  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0640  AsnC family transcriptional regulator  72.14 
 
 		 163 aa  206  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0619  transcriptional regulator, AsnC family  72.14 
 
 		 163 aa  206  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  63.87 
 
 		 160 aa  204  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  63.29 
 
 		 165 aa  203  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1081  AsnC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 168 aa  177  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0559  AsnC family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 162 aa  175  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 164 aa  158  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 164 aa  158  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 185 aa  157  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 164 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  53.64 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  52.32 
 
 		 163 aa  153  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  52.32 
 
 		 163 aa  153  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  36.02 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  35.71 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 155 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  36.08 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  38.27 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4492  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 178 aa  103  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  36.31 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  37.34 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3876  AsnC family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 191 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  37.82 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3149  transcriptional regulator, AsnC family  37.42 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 180 aa  99  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.01 
 
 		 150 aa  99  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0951  putative leucine-responsive regulatory protein  36.31 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0345  Lrp regulator  36.31 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1881  putative leucine-responsive regulatory protein  36.31 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112233  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 153 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 159 aa  99  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0217  putative leucine-responsive regulatory protein  36.31 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  36.08 
 
 		 161 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 161 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 154 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0428  putative leucine-responsive regulatory protein  36.54 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749844  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1797  putative leucine-responsive regulatory protein  36.54 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1387  putative leucine-responsive regulatory protein  36.54 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  31.61 
 
 		 162 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  35.48 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 156 aa  97.8  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 170 aa  97.4  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 150 aa  97.4  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  34.84 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  34.15 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  36.88 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  31.17 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  34.97 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0458  AsnC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 172 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.302522  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  35.48 
 
 		 155 aa  95.1  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 154 aa  95.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  34.36 
 
 		 175 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  34.36 
 
 		 175 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1100  leucine-responsive regulatory protein, putative  36.13 
 
 		 169 aa  94.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121035  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  34.36 
 
 		 175 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 200 aa  94.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 200 aa  94.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 169 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  34.36 
 
 		 175 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 158 aa  94.4  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  35.9 
 
 		 152 aa  94.4  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  35.9 
 
 		 152 aa  94.4  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>