More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0356 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  323  8.000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  51.35 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  39.07 
 
 		 173 aa  123  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  39.07 
 
 		 173 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 180 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  36.18 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  32.9 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 171 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.08 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  31.08 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 168 aa  100  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  34.87 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 163 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 163 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  34.21 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  39.73 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  35.03 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 185 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0850  glutamate uptake regulatory protein Grp  33.77 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  35.03 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  35.03 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  35.03 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4109  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  97.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 165 aa  97.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 171 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 163 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  30.41 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  36.18 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  30.41 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  30.41 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.892509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  30.41 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 		 155 aa  97.1  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  30.41 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 172 aa  96.7  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2868  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2804  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  35.26 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>