More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4109 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4109  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0764  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267919  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 153 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 188 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  43.79 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  43.79 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  43.79 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  43.79 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 202 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  43.79 
 
 		 229 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  44.81 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 202 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  43.51 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  43.14 
 
 		 229 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 169 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  39.38 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  39.38 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.21 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 155 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 166 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  38.75 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  40.13 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  40.13 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  40.13 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  40.13 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 169 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03485  regulatory protein, AsnC/Lrp  39.74 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 169 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 177 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.4 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 181 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.38 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  42 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 282 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1883  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>