More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04927 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  331  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  68.59 
 
 		 165 aa  227  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 155 aa  173  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  50.33 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  48.41 
 
 		 162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  50.33 
 
 		 160 aa  160  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 165 aa  154  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 165 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 192 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  45.7 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  46.36 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  45.7 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 192 aa  140  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  43.67 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  43.67 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  42 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  41.18 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  41.18 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  41.18 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  41.18 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  35.85 
 
 		 173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  35.85 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 150 aa  121  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  34.84 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  34.21 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  32.68 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  31.13 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  35.22 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  34.19 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0948  AsnC family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 121 aa  97.4  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  33.79 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  31.79 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 154 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30.67 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4270  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.34453  normal  0.84826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 177 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1672  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.483706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30.32 
 
 		 155 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  28.76 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 152 aa  94  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  93.6  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2393  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>