More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3180 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  324  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  47.47 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 162 aa  150  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  43.95 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 192 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  37.34 
 
 		 161 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 165 aa  124  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 192 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  37.06 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  37.06 
 
 		 153 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  37.06 
 
 		 153 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  37.06 
 
 		 153 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  34.67 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 160 aa  98.2  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  34 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 165 aa  94  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 165 aa  94  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  32.69 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  28 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  27.33 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  24.83 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 188 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0948  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  31.33 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4109  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  25.33 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  29.22 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  29.22 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.62 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3088  AsnC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  24.67 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  28.67 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>