More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1264 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 161 aa  330  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  34.84 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  36.54 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  36.54 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  31.13 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  38.85 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  32 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 168 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 192 aa  94.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  29.41 
 
 		 173 aa  94  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  29.41 
 
 		 173 aa  94  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 162 aa  90.5  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 156 aa  90.5  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  33.11 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  33.11 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  33.11 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  33.11 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  31.58 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 157 aa  84.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  34.42 
 
 		 161 aa  84.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 158 aa  84  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0598  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 170 aa  84  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 158 aa  84  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0093  AsnC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.867547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5387  transcriptional regulator, AsnC family  30.46 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138805  normal  0.471727 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.62 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  39.62 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0920  AsnC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.681617  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0883  transcriptional regulator, AsnC family  30.25 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0448887  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  27.33 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  27.33 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0739  AsnC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0726  AsnC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191763  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  33.99 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.45 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0994  transcriptional regulator, AsnC family  31.9 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  35.38 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  31.41 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.33 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  28.85 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  32.08 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  31.17 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  31.13 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  31.13 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.892509 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  31.13 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  31.13 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  31.13 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  30.72 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>