More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5010 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  100 
 
 		 155 aa  313  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  86.27 
 
 		 154 aa  273  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  85.62 
 
 		 154 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  62.99 
 
 		 165 aa  207  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  62.34 
 
 		 165 aa  204  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  62.34 
 
 		 165 aa  204  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  42 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 192 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  44.35 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  37.33 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  33.79 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 192 aa  103  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 158 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  33.79 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 		 160 aa  97.1  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 180 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  34.97 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  34.97 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  34.97 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  34.97 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 161 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5406  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  32.19 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0951  putative leucine-responsive regulatory protein  29.37 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0345  Lrp regulator  29.37 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1100  leucine-responsive regulatory protein, putative  29.37 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121035  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0217  putative leucine-responsive regulatory protein  29.37 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1797  putative leucine-responsive regulatory protein  29.37 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0428  putative leucine-responsive regulatory protein  29.37 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749844  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1387  putative leucine-responsive regulatory protein  29.37 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1881  putative leucine-responsive regulatory protein  29.37 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1802  regulatory proteins, AsnC/Lrp  28.87 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596593  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  28.76 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5396  transcriptional regulator, AsnC family  28.28 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1611  normal  0.0284366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  28.76 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  27.27 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  28.29 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  31.97 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0870  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592101  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3674  transcriptional regulator, AsnC family  27.46 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1263  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106245  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4141  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.845485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4793  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3375  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5098  transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3829  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  27.63 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  28.1 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3149  transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  28.48 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3597  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.680866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  25.83 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4492  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3876  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  28.67 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4759  AsnC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2310  AsnC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1404  transcriptional regulator, AsnC family  26.14 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 169 aa  73.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  27.97 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>