More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1404 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1404  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 153 aa  314  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1508  transcriptional regulator, AsnC family  96.08 
 
 		 153 aa  304  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0615903  normal  0.388273 
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  42.76 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  41.38 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  41.38 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 162 aa  130  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.07 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  44.22 
 
 		 157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  44.22 
 
 		 157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  42.86 
 
 		 156 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  39.46 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 156 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 156 aa  124  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.06 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 171 aa  123  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  38.78 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  41.5 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  37.24 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  41.73 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 152 aa  115  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0850  glutamate uptake regulatory protein Grp  37.24 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0580  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 178 aa  114  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015391  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004016  putative HTH-type transcriptional regulator ybaO  35.86 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 169 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 198 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.93 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 282 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 169 aa  110  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2055  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 158 aa  110  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.650647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1883  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.79 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  38.24 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 213 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>