More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4424 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  313  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  71.24 
 
 		 158 aa  234  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  69.74 
 
 		 159 aa  234  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  53.25 
 
 		 161 aa  173  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 155 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  38.82 
 
 		 173 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 192 aa  134  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  38.82 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 180 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  42.07 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  42.07 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  42.07 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  42.07 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  39.68 
 
 		 126 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  38.82 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  37.5 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 192 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 152 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 177 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  36.18 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  36.18 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  36.18 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  34.21 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.1 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  34.87 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  38 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  33.77 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  41.8 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5387  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138805  normal  0.471727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  33.99 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  100  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  35.29 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  34.21 
 
 		 163 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 158 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  33.55 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 159 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 158 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>