More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1009 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  100 
 
 
153 aa  309  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  100 
 
 
153 aa  309  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  100 
 
 
153 aa  309  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  99.35 
 
 
153 aa  307  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  50.67 
 
 
162 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
192 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 
155 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 
158 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  47.02 
 
 
160 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 
158 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 
158 aa  147  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  48.03 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 
158 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
180 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  41.18 
 
 
161 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
165 aa  134  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
162 aa  134  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  47.68 
 
 
158 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  47.68 
 
 
158 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 
192 aa  130  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  41.18 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
155 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
150 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
150 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  47.97 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  33.77 
 
 
173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  33.77 
 
 
173 aa  110  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
160 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  36.18 
 
 
158 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
154 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
150 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  38.62 
 
 
157 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 
157 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
152 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  37.1 
 
 
152 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  37.1 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  35.03 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  37.1 
 
 
153 aa  97.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  36.29 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  37.5 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
165 aa  97.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 
152 aa  97.1  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0948  AsnC family transcriptional regulator  46.46 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  39.06 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
165 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  35.86 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
177 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
154 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  34.97 
 
 
155 aa  93.6  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
165 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
165 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 
176 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
152 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
153 aa  92  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  33.11 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  39.69 
 
 
157 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  33.55 
 
 
165 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
154 aa  90.5  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  34.48 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  34.48 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  34.48 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
152 aa  90.5  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
164 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  30.87 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  30.87 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
164 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 
182 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
167 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 
182 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
162 aa  89.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  29.53 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 
182 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>