More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0983 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
150 aa  309  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
150 aa  309  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  47.65 
 
 
158 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  47.65 
 
 
158 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  48.99 
 
 
160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 
161 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  45.95 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  45.27 
 
 
162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 
158 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 
158 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 
192 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
162 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
155 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  41.06 
 
 
153 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  41.06 
 
 
153 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  41.06 
 
 
153 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  41.06 
 
 
153 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0948  AsnC family transcriptional regulator  49.51 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  41.22 
 
 
160 aa  114  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
158 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  34 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  35.33 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
160 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
160 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
155 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
165 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
153 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  33.56 
 
 
173 aa  96.7  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  32.89 
 
 
173 aa  96.7  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  33.33 
 
 
158 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
160 aa  94.4  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
155 aa  94  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  32.43 
 
 
161 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
164 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
164 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
160 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
153 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
168 aa  86.7  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  31.71 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 
173 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
160 aa  84.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  31.71 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  32.82 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2964  AsnC family transcriptional regulator  34.96 
 
 
172 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116625  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2701  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
159 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0065289  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1178  regulatory protein AsnC/Lrp family  33.33 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  30.56 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  32.8 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  31.03 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  28.97 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  31.29 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5387  transcriptional regulator, AsnC family  31.03 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138805  normal  0.471727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  36.67 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  25.85 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  25.85 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  30.67 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  26.03 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1883  AsnC family transcriptional regulator  36.21 
 
 
150 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>