More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4919 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  337  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  68.59 
 
 		 161 aa  227  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  53.64 
 
 		 162 aa  177  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  49.69 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  49.69 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  47.4 
 
 		 158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  51.3 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 155 aa  157  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  46.84 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  44.03 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  44.03 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  42 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  42 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  42 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  42 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 180 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  41.26 
 
 		 173 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  41.26 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 158 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  40.67 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 188 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  37.97 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  40.91 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  36 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 152 aa  104  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  34.44 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 153 aa  101  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  101  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3320  AsnC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 170 aa  101  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0097323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 160 aa  100  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 163 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  32.89 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  34 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  32.26 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 157 aa  98.2  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  33.33 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  33.33 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  33.33 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 152 aa  97.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 162 aa  97.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  30.67 
 
 		 162 aa  97.8  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 163 aa  97.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 152 aa  97.4  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 185 aa  97.1  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>