More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3408 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 192 aa  181  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  50.67 
 
 		 160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  52 
 
 		 162 aa  160  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  52 
 
 		 160 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  52 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  52 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  47.97 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  47.97 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  47.97 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  47.3 
 
 		 153 aa  137  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 180 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  39.87 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  35.76 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  39.33 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  35.76 
 
 		 173 aa  120  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  39.33 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  38.85 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  47.54 
 
 		 126 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 165 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 165 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.84 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  35.33 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 163 aa  97.1  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2310  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 153 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.09 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1081  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 161 aa  91.3  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  37.33 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  37.33 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  37.33 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  36.67 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 155 aa  91.3  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 153 aa  90.9  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 153 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 156 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  35.33 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  33.99 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0850  glutamate uptake regulatory protein Grp  36.67 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2868  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 198 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1694  transcriptional regulator, AsnC family  37.9 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.849273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1263  AsnC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106245  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>