More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3051 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
160 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
160 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  49.69 
 
 
165 aa  167  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 
155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 
159 aa  156  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  51.03 
 
 
173 aa  154  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  51.03 
 
 
173 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  45.33 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  47.33 
 
 
158 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
180 aa  144  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  44.94 
 
 
162 aa  141  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 
158 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
155 aa  140  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
158 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 
154 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  41.56 
 
 
160 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
165 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  41.77 
 
 
192 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
155 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
165 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5387  transcriptional regulator, AsnC family  34.87 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138805  normal  0.471727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.97 
 
 
163 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  39.22 
 
 
159 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
158 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  39.86 
 
 
153 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  39.86 
 
 
153 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
154 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  39.86 
 
 
153 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  39.86 
 
 
153 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
164 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
164 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  37.91 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  39.07 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  39.07 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
164 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
164 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
164 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
164 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
163 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  38.56 
 
 
161 aa  110  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
163 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
185 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 
163 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
163 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  37.09 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  43.55 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 
154 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  36.42 
 
 
157 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  38.75 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 
155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.67 
 
 
156 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
157 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 
161 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
160 aa  107  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.33 
 
 
159 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  39.87 
 
 
155 aa  107  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
150 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 
152 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
150 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 
156 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  35.1 
 
 
155 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  36 
 
 
152 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
165 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
159 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
154 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 
155 aa  104  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  35.03 
 
 
161 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
154 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 
153 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  35.03 
 
 
161 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
154 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
152 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  34 
 
 
152 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
154 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
162 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  37.75 
 
 
155 aa  104  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
154 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>