More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3718 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  314  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  44.74 
 
 
173 aa  141  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  44.74 
 
 
173 aa  140  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 
160 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 
160 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 
165 aa  134  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
155 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  38.96 
 
 
161 aa  130  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 
162 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 
192 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
192 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  39.31 
 
 
158 aa  117  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 
160 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  40.52 
 
 
158 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  39.47 
 
 
155 aa  114  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  36.42 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1629  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00470119 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0399  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 
181 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  35.95 
 
 
157 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
157 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 
160 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  35.57 
 
 
155 aa  110  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 
164 aa  110  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
156 aa  110  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  34.87 
 
 
167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  38.82 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  34.87 
 
 
167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
152 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  36 
 
 
158 aa  108  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  35.57 
 
 
168 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  35.57 
 
 
168 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  35.57 
 
 
168 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  35.57 
 
 
168 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
157 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  34.9 
 
 
164 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 
164 aa  107  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  34.87 
 
 
168 aa  107  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3320  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
170 aa  107  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0097323  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  34.87 
 
 
168 aa  107  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  34.9 
 
 
164 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  34.87 
 
 
168 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  34.87 
 
 
168 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  34.87 
 
 
168 aa  107  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.14 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  35.14 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1428  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 
159 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2419  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
159 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  39.22 
 
 
157 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 
160 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
155 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  35.57 
 
 
167 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
156 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  34.87 
 
 
167 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  38.56 
 
 
157 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
158 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  34.23 
 
 
164 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  34.21 
 
 
167 aa  104  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  32.67 
 
 
153 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  32.67 
 
 
153 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  32.67 
 
 
153 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  32.67 
 
 
153 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  36.67 
 
 
152 aa  103  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
152 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  34.46 
 
 
152 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>