More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4782 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
160 aa  324  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  79.38 
 
 
161 aa  270  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  84.31 
 
 
160 aa  266  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  66.67 
 
 
162 aa  208  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  54.97 
 
 
192 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  54.55 
 
 
158 aa  174  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  55.19 
 
 
158 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  55.19 
 
 
158 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  54.55 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  54.3 
 
 
158 aa  167  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  53.64 
 
 
158 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  54 
 
 
158 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  54 
 
 
158 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  50.33 
 
 
161 aa  160  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  51.3 
 
 
165 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
192 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  54.05 
 
 
162 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 
180 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  50.67 
 
 
160 aa  147  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  48.03 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  46.71 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  48.03 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  48.03 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  45.95 
 
 
150 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  45.95 
 
 
150 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 
158 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  47.37 
 
 
153 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 
155 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
155 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
155 aa  127  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  35.14 
 
 
173 aa  120  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  35.14 
 
 
173 aa  121  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 
153 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
154 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  36.42 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
150 aa  111  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  42.4 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0948  AsnC family transcriptional regulator  50.47 
 
 
121 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
155 aa  107  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 
154 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 
154 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
164 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
163 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
164 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
163 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
163 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
163 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
185 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
163 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
163 aa  97.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 
160 aa  97.4  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  34.67 
 
 
155 aa  97.1  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  31.13 
 
 
166 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
171 aa  96.3  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
159 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0093  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 
192 aa  93.6  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.867547  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  31.37 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
164 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
165 aa  91.7  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4109  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  30.2 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
166 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
164 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  35.58 
 
 
161 aa  90.5  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
164 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  35.58 
 
 
161 aa  90.5  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
164 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
164 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  27.85 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 
167 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.27 
 
 
167 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
167 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  28 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  89  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  27.95 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
157 aa  88.6  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  39.32 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
188 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>